浪潮发布新一代基因一体机 全基因组分析性能提升3倍!

2019-08-19 15:39 评论 0 条

  【IT168 资讯】9月12日,浪潮联合英特尔在京发布新一代基因一体机浪潮GeneEngine M2。该基因一体机由浪潮研发,集成基因分析解决方案BIGstack,融合最新英特尔计算与加速技术,实测数据显示全基因组分析性能较上一代最大可提升3倍以上。

浪潮发布新一代基因一体机 性能提升3倍
▲浪潮、英特尔联合发布新一代基因一体机

  浪潮新一代基因一体机GeneEngine M2基于英特尔BIGstack架构,内置最新的GATK3.8版本和Cromwell/WDL流程管理系统,实测数据显示,采用双路新一代Intel? Xeon? Gold处理器的浪潮基因一体机M2,关键业务流程序列比对和查找突变运行时间较上一代分别缩短23%和37%,而采用基于Intel? Arrial10芯片的浪潮F10A FPGA卡搭配FalconComputing加速GATK的浪潮基因一体机M2,全基因分析流程时间较上一代可提升3.4倍。

浪潮发布新一代基因一体机 性能提升3倍
▲浪潮新一代基因一体机GeneEngine M2实测数据

  当前,随着高通量测序技术的飞速发展,单次测序数据量得到大幅提升,这为后端的基因数据计算处理带来很大挑战。以2017年illumina推出NovaSeq为例,单次运行40小时即可最多检测 48 个人类基因组伴随产生 6Tb 数据,而之前要完成单人的全基因组数据处理一般需要5天时间,基于浪潮新一代基因一体机M2,采用BIGstack集成方案配合最新的计算加速技术,使得全基因组数据处理时间可以大大缩短。

浪潮发布新一代基因一体机 性能提升3倍
▲新一代浪潮基因一体机GeneEngine M2

  浪潮人工智能和高性能服务器产品部总经理刘军表示:“新一代浪潮基因一体机可以更快更好地满足处理客户本地基因数据分析的需求,并提供更好的用户体验和出色的性能,从解决基因分析的效率问题入手,进一步加速精准医疗的发展。”

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